او از حوزه علميه پر محتوى و وسيعى برخوردار بود، به طورى كه سيل مشتاقان علم و دانش، از سرزمينهاى مختلف اسلامى، به سوى اين حوزه علميه سرازير مى‏شدند . 
خصوصيات اخلاقى و رفتارى اين شخصيت بزرگ علمى را مى‏توان در نكات ذيل خلاصه كرد: 
1 همواره به ياد خدا بود و هر كارى را با قصد قربت انجام مى‏داد. 
2 توجه خاصى به مجامع عبادى، مانند نماز جمعه و جماعات داشت . 
3 حفظ سنن ائمه اطهار (ع) و توسل به آنان را جدى مى‏گرفت . 
4 تلاوت قرآن مجيد را به طور مستمر ادامه مى‏داد . 
5 ساده زيستى، روش زندگى او بود . 
6 جلال و وقار، در عين دارا بودن تواضع و اخلاق نيكو، راه و رسم زندگى او بود. 
7 تلاش، كوشش، فداكارى و استقامت و پايدارى در امور را هرگز از دست نمى‏داد . 
اين عالم ربانى خدمات ارزشمندى به جامعه اسلامى ارائه كرد . او علاوه بر مشاغل اجتماعى، اعتقادى، مبارزاتى، در پادشاهان صفويه، به منظور از بين بردن مسلك انحرافى ((صوفيه))، كه با هدف برچيدن بساط تشيع مطرح گرديده بود، نفوذ زياد داشت و مبارزه جدى با هر گونه مظاهر فساد انجام مى‏داد، تربيت و آموزش علماء دينى را در سطح گسترده داشت و تأليفات فراوانى از خود به يادگار گذاشت، كه تعداد آنها بالغ بر هفتاد كتاب مى‏گردد، هر يك از آثار علامه مجلسى، مثل شمعى فروزان فرا راه انديشمندان قرار گرفته و ساليان درازى است كه روح و حيات جاويدان علمى را در اعماق جان تشنگان حقيقت، به ويژه علماء شيعه مى‏دمد. 
علامه محمد باقر مجلسى، بيست و پنج كتاب مهم علمى و حديثى نوشته، كه مهمترين آنها بدين قرار است: 
1 -مرآة العقول، شرح كتاب ((كافى)) علامه كلينى در 28 جلد 
2 ملاذ الاخبار، شرح كتاب ((تهذيب)) شيخ طوسى، در 16 جلد .
3 حياة القلوب، به فارسى در 3 جلد . 
4 حلية المتقين، به فارسى . 
5 عين الحياة، به فارسى . 
6 جلاء العيون . 
7 حق اليقين . 
8 ترجمه توحيد مفضل . 
9 تحفة الزائر . 
10 از آثار مشهور و معروف علامه مجلسى مى‏توان به كتاب ((بحارالانوار )) اشاره كرد، اين كتاب در بيست و پنج جلد قديم تدوين و در تجديد چاپ جديد در يكصد و ده جلد كتاب كه هر جلد آن تقريبا پانصد صفحه دارد تنظيم و منتشر گرديده است . اين كتاب، مجموعه گرانبهائى از تفسير، اصول، فقه، اخلاق، درايه، تاريخ، كلام، حكمت، فلسفه، طب، لغت، ادبيات و نجوم و ... مى‏باشد. 
لازم به يادآورى است كه موضوعات كتاب ((بحارالانوار)) در مركز تحقيقات كامپيوترى علوم اسلامى قم، كه تحت نظر مقام معظم رهبرى فعاليت دارد، به صورت كامپيوترى در آمده است و در بانك اطلاعات اين مركز براى استفاده عموم محققين و دانشمندان ارائه مى‏گردد. 
سرانجام اين عالم مجاهد و تلاشگر در بيست و هفتم ماه رمضان سال 1111 هجرى قمرى و در سن هفتاد و سه سالگى به درود حيات گفت و در مسجد جامع اصفهان به خاك سپرده شد . ?